筛选对EGFR抑制剂吉非替尼作用敏感的PDX个体，根据10x Genomics得到的单细胞转录组数据对细胞进行分群，细胞分为6个亚群，定位EGFR高表达的间叶细胞/干细胞分群，BRCA1突变的细胞系的间叶细胞/干细胞数值(M/S)较高。
论文的通讯作者Ioannis Ragoussis Ph.D担任基因组科学负责人。负责MUGQIC基因组加拿大基因组创新节点中的基因组平台开发和加拿大CFI资助的Genomics Enterprize。负责监督基因组平台操作和新技术评估与整合。实验室致力于技术开发，包括MUGQIC和突变检测技术的单细胞基因组学实验室，重点是单细胞的基因组和转录组学分析。
- a mesenchymal/stem (M/S) cluster ，表现为 EGFR 和mesenchymal相关基因高表达
- the nuclear/mitochondrial cluster，表现为 nuclear 和 mitochondrial基因定位
- a proliferative cluster，表现为细胞周期相关基因高表达
- the antigen presentationcluster，表现为抗原呈递相关基因高表达。
- the basal cluster ，包括 (KRT6A/B, KRT17, KRT14, and KRT5) 等markers
- A transitional cluster ，差异基因太少
用t-SNE 进行聚类后，对于每个cluster寻找 marker 基因。
参考材料：
https://zhuanlan.zhihu.com/p/44909322
http://www.sohu.com/a/236810998_307557