暗之洋光


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NM-第一篇单细胞高通量测序文章

发表于 2019-04-07 | 分类于 文献追踪 , paper
  细胞异质性是生物组织的普遍特征。常规转录组测序(RNA-Seq)技术需要上万个细胞,所测结果实际上是一群细胞基因表达的平均值,所以难以鉴别细胞之间基因表达的异质性。单细胞RNA-Seq技术的分辨率精确至单个细胞,为辨别异质性群体中各种细胞类型的转录组特征提供了有力的工具。近年 ...
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清明自驾一日游

发表于 2019-04-05 | 分类于 心路历程
  来深圳近四年了,驾照领了也仅四年了这是过的第三个清明节,突发奇想要自驾去游玩一些有趣的地方,趁着年轻,其实就算一时的想法,也要去行动。华大基因公寓喜提一辆连陈共享满电状态扯,打客服无果,扯下充电头即飘摇上路。二办临时修整,购入早餐,第一站为人去的较少的官湖海滩。高德地图定位一 ...
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成长路上相伴的优秀博主(持续更新)

发表于 2019-04-04 | 分类于 他山之石
1、综合类博客:专注生物信息,专注转化医学– SAM’S NOTE交大博士在读–在路上关注生信–沈梦圆的博客关注生信–生物日志|鸣一道科学网–刘永鑫的博客科学网–薛良交的博客
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Cell-单细胞ATAC-seq绘制哺乳动物单细胞染色质调控图谱

发表于 2019-04-03 | 分类于 文献追踪 , paper
  DNA就像缠绕在一起的绳索,包装好的DNA被称为染色质,其内部组织影响基因在每个细胞中如何发挥作用。核小体是由DNA与组蛋白形成的染色质基本结构单位,实际上通过移动开启或关闭可阅读的遗传信息,核小体随时处于动态变化,这种状态被称为“染色质的可及性”。上篇文献中简要描述过Gre ...
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Cell-单细胞多组学分析造血分化过程中的转录调控机制

发表于 2019-04-02 | 分类于 文献追踪 , paper
  造血分化是从造血干细胞分化为具有不同功能的细胞过程,在成人中主要发生在骨髓,最终产生淋巴系细胞,髓系-粒系,红系等细胞类型,是研究干细胞分化、肿瘤免疫、血液疾病等的良好模型。造血分化过程是一个复杂、多阶段的,受多种因子调控的过程,单细胞多组学分析有助于解析造血干细胞转录和细胞 ...
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NN-单细胞开放染色质定位技术运用鼠脑发育研究

发表于 2019-04-01 | 分类于 文献追踪 , paper
  ATAC-seq是近年来比较常用的一个检测染色质开放性的方法,增强子、启动子、绝缘子等调控序列是促成组织和发育时空特异性基因表达的重要调节因子,通常调控序列的染色质又会处于比较开放的状态,ATAC这种方法很适合比较广谱的研究顺式调控序列和基因表达调控。单细胞开放染色质定位技术 ...
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Cell-单细胞转录组研究果蝇脑细胞

发表于 2019-03-31 | 分类于 文献追踪 , paper
  测序领域新技术开发基本会首先应用于人或者小鼠等常规模式生物中,然后逐渐推广到其他生物。单细胞技术同样是这样,随着技术的成熟,现在越来越广泛的应用到果蝇,蝾螈以及一些植物等。这篇文章为18年发表在cell杂志上的研究果蝇大脑衰老过程中单细胞转录组图谱。    ...
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NBT-单细胞多组学研究成人脑部细胞

发表于 2019-03-31 | 分类于 文献追踪 , paper
  自2009年汤教授发表单细胞RNA定量测序,至今近10年间单细胞技术得到飞速发展,已发表多种组学的单细胞技术,让科研人员更具体了解每个单细胞的状态,特别对于肿瘤的发生发展,胚胎发育,复杂组织等领域研究更深入。   这篇文章是2017年底发表在国际顶级期刊N ...
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Hello World

发表于 2019-03-31
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